Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI2P10070 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI2P10070 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI2P10070 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI2P10070 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI2P10070 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI2P10070 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI2P10070 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI2P10070 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI2P10070 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI2P10070 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GLI2P10070 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI2P10070 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI2P10070 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI2P10070 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI2P10070 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI2P10070 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI2P10070 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI2P10070 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI2P10070 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI2P10070 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI2P10070 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI2P10070 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI2P10070 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI2P10070 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI2P10070 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI2P10070 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GLI2P10070 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GLI2P10070 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
GLI2P10070 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GLI2P10070 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GLI2P10070 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GLI2P10070 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms