Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms