Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGA3P0DJD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGA3P0DJD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms