Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM6P0DI80 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms