Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFRBP09619 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRBP09619 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms