Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP10P09238 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP10P09238 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP10P09238 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP10P09238 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP10P09238 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP10P09238 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP10P09238 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP10P09238 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP10P09238 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP10P09238 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP10P09238 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP10P09238 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP10P09238 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP10P09238 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP10P09238 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP10P09238 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP10P09238 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP10P09238 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP10P09238 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP10P09238 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP10P09238 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP10P09238 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP10P09238 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP10P09238 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP10P09238 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP10P09238 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP10P09238 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms