Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms