Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPSAP08865 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPSAP08865 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPSAP08865 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPSAP08865 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPSAP08865 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPSAP08865 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPSAP08865 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPSAP08865 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPSAP08865 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPSAP08865 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPSAP08865 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPSAP08865 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPSAP08865 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPSAP08865 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPSAP08865 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPSAP08865 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPSAP08865 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPSAP08865 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms