Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKMP08237 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKMP08237 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKMP08237 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKMP08237 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKMP08237 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKMP08237 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKMP08237 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKMP08237 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKMP08237 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PFKMP08237 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PFKMP08237 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PFKMP08237 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PFKMP08237 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PFKMP08237 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PFKMP08237 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms