Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CSF1RP07333 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSF1RP07333 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms