Protein–RNA interactions for Protein: P01718

IGLV3-27, Immunoglobulin lambda variable 3-27, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-27P01718 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGLV3-27P01718 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-27P01718 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms