Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFNA1P01562 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA1P01562 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms