Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL1O95922 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL1O95922 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms