Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF6BO95407 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF6BO95407 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms