Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE8BO95263 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE8BO95263 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms