Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF6O94906 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF6O94906 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF6O94906 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms