Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BBOX1O75936 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms