Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCNKO75909 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNKO75909 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNKO75909 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNKO75909 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNKO75909 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCNKO75909 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNKO75909 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNKO75909 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNKO75909 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNKO75909 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCNKO75909 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCNKO75909 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCNKO75909 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCNKO75909 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNKO75909 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNKO75909 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms