Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMUO75648 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMUO75648 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMUO75648 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMUO75648 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMUO75648 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRMUO75648 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRMUO75648 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRMUO75648 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRMUO75648 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRMUO75648 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRMUO75648 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMUO75648 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMUO75648 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMUO75648 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms