Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN11O75508 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN11O75508 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN11O75508 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms