Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F6O75461 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F6O75461 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F6O75461 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F6O75461 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F6O75461 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F6O75461 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F6O75461 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F6O75461 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F6O75461 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms