Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GADD45BO75293 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GADD45BO75293 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45BO75293 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms