Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF40O75150 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF40O75150 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF40O75150 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RNF40O75150 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF40O75150 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF40O75150 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF40O75150 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF40O75150 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF40O75150 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms