Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B3O60423 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B3O60423 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B3O60423 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP8B3O60423 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B3O60423 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms