Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP104O60308 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP104O60308 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP104O60308 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP104O60308 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP104O60308 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP104O60308 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP104O60308 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP104O60308 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP104O60308 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP104O60308 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP104O60308 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP104O60308 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP104O60308 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP104O60308 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms