Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXTL3O43909 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EXTL3O43909 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms