Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX6O43752 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STX6O43752 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX6O43752 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STX6O43752 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX6O43752 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX6O43752 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX6O43752 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX6O43752 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
STX6O43752 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX6O43752 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX6O43752 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX6O43752 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX6O43752 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX6O43752 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX6O43752 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX6O43752 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX6O43752 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX6O43752 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms