Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM44O43615 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM44O43615 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms