Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCRTO43612 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCRTO43612 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCRTO43612 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCRTO43612 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCRTO43612 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCRTO43612 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCRTO43612 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCRTO43612 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCRTO43612 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCRTO43612 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCRTO43612 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCRTO43612 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCRTO43612 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCRTO43612 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCRTO43612 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCRTO43612 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms