Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPK2O43353 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms