Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEFVO15553 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEFVO15553 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEFVO15553 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEFVO15553 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEFVO15553 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEFVO15553 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MEFVO15553 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEFVO15553 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEFVO15553 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEFVO15553 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MEFVO15553 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEFVO15553 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEFVO15553 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEFVO15553 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEFVO15553 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEFVO15553 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEFVO15553 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEFVO15553 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEFVO15553 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEFVO15553 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEFVO15553 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEFVO15553 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEFVO15553 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEFVO15553 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms