Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN3O15232 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN3O15232 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN3O15232 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN3O15232 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN3O15232 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN3O15232 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN3O15232 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN3O15232 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN3O15232 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN3O15232 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN3O15232 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN3O15232 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms