Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHUKO15111 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHUKO15111 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHUKO15111 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHUKO15111 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHUKO15111 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHUKO15111 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHUKO15111 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHUKO15111 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms