Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASKO14936 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASKO14936 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASKO14936 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASKO14936 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASKO14936 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASKO14936 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASKO14936 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASKO14936 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASKO14936 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASKO14936 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASKO14936 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASKO14936 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASKO14936 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASKO14936 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASKO14936 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASKO14936 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CASKO14936 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms