Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIPC1O14908 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIPC1O14908 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms