Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRTO14522 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRTO14522 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
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