Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F3O00716 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E2F3O00716 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F3O00716 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F3O00716 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F3O00716 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F3O00716 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F3O00716 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms