Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA3O00505 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms