Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP3B1O00203 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms