Protein–RNA interactions for Protein: J3QR06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR06 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QR06 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QR06 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QR06 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QR06 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QR06 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QR06 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QR06 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QR06 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QR06 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QR06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms