Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCER2I3L3R5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCER2I3L3R5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms