Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
hCG_1984214I3L0E3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
hCG_1984214I3L0E3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
hCG_1984214I3L0E3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms