Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC188H7C350 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms