Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1H1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1H1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H7C1H1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H7C1H1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms