Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E9PMD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PMD0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PMD0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PMD0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PMD0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PMD0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PMD0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PMD0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PMD0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PMD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PMD0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PMD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PMD0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PMD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PMD0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PMD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PMD0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PMD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PMD0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms