Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L12C9JPN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L12C9JPN9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms