Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA1C9JL84 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA1C9JL84 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA1C9JL84 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms