Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UPK3BL1B0FP48 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL1B0FP48 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms