Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMTNL1A8MU46 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMTNL1A8MU46 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNL1A8MU46 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms