Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NOTOA8MTQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NOTOA8MTQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NOTOA8MTQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms